PLIP 2025: 단백질-단백질 상호작용 분석
PLIP(protein-ligand interaction profiler)은 단백질 구조 내 분자 상호작용을 분석하는 도구로, 8가지 유형의 비공유 결합을 탐지합니다. 기존에는 소분자, DNA, RNA와 단백질 간의 상호작용에 초점을 맞추었으나, 이번 PLIP 2025 버전에서는 단백질-단백질 상호작용 분석 기능을 새롭게 추가했습니다. 연구팀은 암 치료제 베네토클락스(venetoclax)와 Bcl-2 및 BAX 단백질 간의 상호작용을 PLIP으로 분석하여, 이 기능의 유용성을 입증했습니다. 베네토클락스는 Bcl-2와 BAX의 고유한 단백질-단백질 상호작용을 모방하는 방식으로 작용하며, PLIP 분석 결과 이러한 모방 메커니즘이 상호작용 프로파일의 중요한 중첩을 통해 명확히 드러났습니다. PLIP은 웹 서버, 컨테이너를 포함한 소스 코드, Jupyter 노트북 형태로 제공되어 연구자들이 쉽게 접근하고 활용할 수 있습니다. 이 업데이트는 단백질 상호작용 연구에 중요한 도구를 제공하며, 약물 작용 메커니즘 이해와 신약 개발에 기여할 것으로 기대됩니다.