생물 다양성 유전체 참조 표준 구축
웰컴 생어 연구소의 Tree of Life 프로그램은 2019년 시작 이래 2,000종 이상의 생물에 대한 고품질의 염색체 수준 유전체 참조 표준을 발표했습니다. 이 프로그램의 핵심은 여러 팀으로 구성되어 있으며, 각 팀은 '유전체 엔진'의 주요 구성 요소를 담당합니다. 그중 Tree of Life 핵심 연구실은 다양한 종의 조직에서 고품질, 고분자량 DNA와 온전한 RNA를 추출하고, Hi-C 분석을 위한 조직을 준비하는 역할을 수행합니다. 본 연구에서는 식물, 균류, 척삭동물, 원생생물, 절지동물, 중형동물 및 기타 후생동물을 포함하는 광범위한 종을 성공적으로 처리하기 위해 개발된 다양한 워크플로우를 상세히 기술합니다. 특히, 조직 처리 과정에서 발생하는 문제점을 극복하고 일관된 고품질 샘플을 확보하기 위한 최적화된 프로토콜 개발에 중점을 두었습니다. 우리는 이러한 워크플로우의 성공률을 종합적으로 분석하고, 현재 공개적으로 사용 가능한 프로토콜(protocols.io)들을 가장 효과적으로 적용하고 결합하는 방법을 제시합니다. 이를 통해 다양한 생물종의 유전체 연구를 위한 표준화된 접근 방식을 제공합니다. 본 연구에서 제시된 방법론과 프로토콜은 생물 다양성 전반에 걸친 유전체 참조 표준 구축 노력을 가속화하고, 향후 유전체 연구의 효율성과 재현성을 크게 향상시킬 것으로 기대됩니다.