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질량분석이미징

2의 한국어 분석 — 최신순으로 정렬했어요

화학발표 2026.09· 0

MALDI-MSI 펩타이드 동위원소 식별

질량 분석 이미징(MSI) 실험에서 얻어지는 방대한 펩타이드 데이터는 동위원소 봉투(isotopic envelope) 식별에 어려움을 야기합니다. 기존 방법들은 주로 스펙트럼 정보에 의존하여 분석의 한계가 있었습니다. 본 연구는 이러한 문제를 해결하기 위해 공간 분포 정보를 활용하는 새로운 접근법인 DeisoLAB을 제안합니다. DeisoLAB은 퍼지 추론 시스템과 펩타이드의 공간 분포 분석을 결합합니다. 맘다니-아실란(Mamdani-Assilan) 퍼지 추론 시스템을 통해 잠재적인 동위원소 봉투 구성원을 1차적으로 식별한 후, 이들의 공간 분포를 2차적으로 분석합니다. 각 분석물의 공간 분포는 조직 전체에 걸쳐 m/z별 피크 강도를 반영하는 분자 분포 공간 맵으로 시각화됩니다. 동위원소 봉투 내 구성원과 비구성원 간의 공간 맵 차이를 측정하기 위해 여러 이미지 텍스처 측정 지표가 적용되었습니다. 이를 기반으로 나이브 베이즈(Naïve Bayes) 분류기를 사용하여 피크를 동위원소 봉투 및 비동위원소 봉투의 두 가지 클래스로 분류했습니다. 이 방법은 신선 동결 및 포르말린 고정 파라핀 포매 조직을 포함한 8개 MALDI-MSI 데이터셋에서 평가되었습니다. 퍼지 추론 시스템 기반 필터링은 추가 분석이 필요한 후보 피크 쌍의 수를 효과적으로 줄였으며, 이후 공간 분포 기반 분류는 88.12–94.12%의 재현율, 72.95–85.71%의 정밀도, 그리고 99% 이상의 특이도를 달성했습니다. 전체 탈동위원소화 정확도는 96.98%에 이르렀습니다. DeisoLAB은 MSI 데이터의 고유한 특징인 공간 분자 분포를 활용하여 개별 동위원소 봉투의 차별화 가능성을 크게 확장합니다.

화학발표 2026.08· 2최근 1년 2

질량 분석 이미징의 시각화 개선

질량 분석 이미징(MSI)은 고차원 분자 데이터를 생성하지만, 기존 시각화 방법들은 데이터의 전역적 구조를 불완전하게 보존하여 해석에 한계가 있었습니다. 본 연구는 이러한 문제를 해결하기 위해 MSI-VISUAL이라는 오픈소스 프레임워크를 제안합니다. 이 프레임워크는 데이터의 전역적 구조를 충실하게 보존하는 차원 축소 시각화 기법을 통합하여 MSI 데이터의 상호작용적 분석을 가능하게 합니다. MSI-VISUAL은 SALO, SPEAR, TOP3, PR3D의 네 가지 새로운 시각화 전략을 도입합니다. SALO와 SPEAR는 다양한 거리 측정법에서 전역적 구조 보존을 최적화하도록 설계된 방법이며, TOP3와 PR3D는 대규모 데이터셋의 메모리 효율적이고 신속한 시각화를 위한 경량 접근 방식입니다. 이 전략들은 관심 영역 선택, 통계적 비교, 그리고 직접적인 질량/전하비(m/z) 매핑 기능을 제공합니다. 생쥐 뇌 및 신장 병리 사례를 포함한 벤치마크 및 지질체학 연구를 통해, 제안된 방법들은 기존의 일반적인 대안들보다 우수한 성능을 보였습니다. 특히 미묘한 조직 차이를 더 효과적으로 감지하고, 생물학적 통찰을 뒷받침하는 미세한 분자-해부학적 패턴을 밝혀냈습니다. 이러한 결과는 MSI-VISUAL이 발견 지향적 및 진단적 MSI 워크플로우를 위한 확장 가능한 프레임워크임을 입증합니다. 이를 통해 MSI 데이터의 심층적인 탐색과 해석이 가능해져 화학 및 생물학 연구에 크게 기여할 것으로 기대됩니다.

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